Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms