Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms