Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxa2P31245 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxa2P31245 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxa2P31245 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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