Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms