Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vav1P27870 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vav1P27870 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vav1P27870 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms