Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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