Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms