Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a2P20490 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a2P20490 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms