Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VimP20152 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VimP20152 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VimP20152 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms