Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrphP15331 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrphP15331 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms