Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hoxc6P10629 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hoxc6P10629 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxc6P10629 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxc6P10629 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc6P10629 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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