Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Syngr1O55100 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Syngr1O55100 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms