Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BckdkO55028 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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