Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SlkO54988 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SlkO54988 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SlkO54988 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SlkO54988 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SlkO54988 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms