Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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