Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cavin1O54724 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms