Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccrl2O35457 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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