Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MttpO08601 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MttpO08601 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MttpO08601 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MttpO08601 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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