Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm2035J3QP87 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm2035J3QP87 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm2035J3QP87 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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