Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm17577J3QNF7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm17577J3QNF7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm17577J3QNF7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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