Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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