Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScaperF8VQ70 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms