Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms