Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AU019823E9PUQ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AU019823E9PUQ3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms