Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a6B1AVK5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a6B1AVK5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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