Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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