Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
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