Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms