Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka4Q9Z2B9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms