Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lgr5Q9Z1P4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms