Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek3Q9R0A5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nek3Q9R0A5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nek3Q9R0A5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nek3Q9R0A5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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