Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp11cQ9QZW0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp11cQ9QZW0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms