Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASSF1Q9NS23 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms