Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nectin3Q9JLB9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nectin3Q9JLB9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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