Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmg1Q9JK23 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmg1Q9JK23 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms