Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Wdr61Q9ERF3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms