Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpgrip1Q9EPQ2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms