Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms