Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne8Q9DC53 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne8Q9DC53 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms