Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx5Q9D8U8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx5Q9D8U8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx5Q9D8U8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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