Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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