Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms