Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cfap53Q9D439 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfap53Q9D439 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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