Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shisa9Q9CZN4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms