Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cnih4Q9CX13 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cnih4Q9CX13 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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