Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ctnnbl1Q9CWL8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ctnnbl1Q9CWL8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ctnnbl1Q9CWL8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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