Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab5aQ9CQD1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms