Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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