Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Sh3bp5lQ99LH9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Sh3bp5lQ99LH9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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