Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms